Tratamentul se alege în funcție de localizarea, dimensiunea și numărul leziunilor, precum și de particularitățile pacientului. Imiquimodul este un imunomodulator topic utilizat pentru anumite condiloame genitale externe și se administrează conform schemei recomandate de medic.
În timpul utilizării pot apărea reacții inflamatorii locale. În funcție de caz, medicul poate recomanda și alte metode, inclusiv tratamente topice sau proceduri precum crioterapia, ablația ori excizia.