Les lésions cliniques comprennent des condylomes visibles au niveau vulvaire, vaginal ou périanal, sous forme d'excroissances molles, roses ou grises, ressemblant à un « chou-fleur ». Dans d'autres cas, l'infection peut être latente, sans symptômes visibles, détectable uniquement par des tests spécifiques. L'inconfort local peut inclure des démangeaisons ou une légère sensation de brûlure.