Cauza principală este colonizarea bacteriană a tractului urinar, frecvent cu E. coli. Factori favorizanți includ igiena inadecvată, retenția urinară, dezechilibrele florei vaginale, diabetul sau imunodeficiența minoră. Inflamația mucoasei vezicale crește sensibilitatea locală și favorizează senzația de arsură.